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一、总分支机构的法律定义和法律地位
　　法人分支机构是以法人财产设立的相对独立活动的法人组成部分，在某种情况下，为了便于拓展业务，法人可以设立分支机构，独立活动的法人分支机构也需要进行登记，如企业法人分支机构要进行营业登记，但法人分支机构仍属于法人的组成部分，主要表现在其目的事业须在法人范围之内，其行为效力仍由法人承担，不具有独立责任能力，与有独立责任能力的母公司之子公司不同。法人的分支机构与法人的机关也不同，法人机关对内形成法人的意思、对外法人为民事法律行为，而法人分支机构在参与民事活动时能不能形成自己的独立意思，须有法人机关的授权，但对外不得代表法人。
　　《中华人民共和国担保法》第10条规定，企业法人的分支机构、职能部门不得为保证人，企业法人的分支机构有法人的书面授权的，可以在授权的范围内提供担保。第29条规定，企业法人的分支机构未经法人书面授权或者超出授权范围与债权人订立的保证合同，该合同无效或者超出授权范围的无效。进一步佐证了分公司缺乏独立的法人资格的现状，以及承担民事能力的限制性。
　　在国际上，对企业征收所得税一般采用公司法人所得税的形式。以公司法人作为基本纳税单位，有利于合理规范企业所得税纳税人。目前公司法、合伙企业法已经出台，一般说来，分公司没有法人资格，理应由总公司汇总纳税，由总公司完全承担纳税责任。合伙企业没有法人资格属于自然人，应当缴纳个人所得税。随着现代企业制度的建立，中国的市场主体也要逐步按独资企业、合伙企业和公司来规范，对于没有法人资格而属于自然人性质的独资私营企业，应纳入个人所得税征税范围。以法人作为基本纳税实体，有利于在个人所得税与企业所得税之间划定合理界限。实行法人税制，有利于实施消除重复征税的所得税一体化措施。可与国际上大多数国家的做法基本一致，便于国际比较。
　　但是，一人有限公司属于有限责任公司的范畴，公司的股东承担有限责任，公司具有独立的法人资格，并且公司财产和股东个人财产要明确区分，应缴纳企业所得税

　　二、总分支机构之间交易（同一县市、非同一县市）的税务处理要点
　　（1）移送货物（存货、固定资产）　

　　（2）总分支机构其他交易的涉税问题：
　　§1增值税处理
　　总分支机构实行独立核算的纳税人，发生内部资产、产品的转移，无论有偿或无偿转让货物的所有权，为货物移送的当天，缴纳增值税；对统一核算的总分机构间转移产品、资产（为有形动产），依据《增值税暂行条例实施细则》第四条的规定，如果不是用于销售的，则受货机构不需缴纳增值税，如果是用于销售，不在同一县市。受货机构应视同销售缴纳增值税。但是，在全国实行营改增试点之后，总分机构之间相互提供营改增应税服务的税务处理有待税务机关明确
　　实务中，基于管理需要，经常会出现分公司购进货物，发票开具给总公司并在总公司抵扣的情况，建议关注涉税风险，：《国家税务总局关于加强增值税征收管理若干问题的通知》（国税发[1995]192号）规定，纳税人购进货物或应税劳务、支付运输费用，所支付款项的单位，必须与开具抵扣凭证的销货单位、提供劳务的单位一致，才能够申报抵扣进项税额，否则不予抵扣。根据上述规定，采购材料时存在付款账号和发票名称不一致，将不允许抵扣。
　　但是，国家税务总局等财税部门对特定企业下发过文件的除外，如《国家税务总局关于诺基亚公司实行统一结算方式增值税进项税额抵扣问题的批复》（国税函[2006]1211号）规定，对诺基亚各分公司购买货物从供应商取得的增值税专用发票，由总公司统一支付货款，造成购进货物的实际付款单位与发票上注明的购货单位名称不一致的，不属于《国家税务总局关于加强增值税征收管理若干问题的通知》（国税发[1995]192号）第一条第（三）款有关规定的情形，允许其抵扣增值税进项税额。
　　§2营业税处理
　　在2009年以前，依据《财政部、国家税务总局关于明确【营业税暂行条例实施细则】第十一条有关问题的通知》（财税（2001）160）号规定，法人单位才是营业税的纳税人，非法人单位不是营业税纳税人。因此总分支机构之间对内提供的营业税收入不缴纳营业税。但是，在2009年之后实施新的营业税法规，新税法不再以法人单位作为判断营业税纳税人的标准，而是以税务登记作为判断标准。新营业税暂行条例实施细则第十条规定，负有营业税纳税义务的单位为发生应税行为并收取货币、货物或者其他经济利益的单位，但不包括单位依法不需要办理税务登记的内设机构。根据税收征收管理法第十五条规定，企业在外地设立的分支机构和从事生产、经营的场所、个体工商户和从事生产、经营的事业单位，自领用营业执照之日起30日内，持有关证件，向税务机关办理税务登记。税务机关应当自收到申报之日起30日内审核并发给税务登记证件。按此规定，任何单位只要领取了营业执照，就需要按照税法规定申报办理税务登记。
　　综上所述，不论是法人单位，还是非法人分支机构，只要能够独立进行生产经营活动的，依法都需要办理营业执照，都需要办理税务登记，都是营业税纳税人，必须依法经营、单独纳税。而单位内设机构，如办公室、生产车间、营运销售、财务会计等部门，不能独立完成生产经营任务，依法不需要办理工商登记和税务登记，不是营业税纳税人，无须纳税。
　　另外，依据《营业税暂行条例实施细则》第三条、第五条的规定，总分机构发生内部资产转移，无论有偿或无偿转让不动产所有权或者土地使用权，应当缴纳营业税，如果资产所有权未发生变化，不缴纳营业税。
　　§3印花税税处理
　　另外分公司和分公司、分公司与跨区（市）分公司之间，甚至是分公司与总公司之间签订的合同包括具有合同性质的凭证，应当按照规定缴纳印花税，文件依据为：《国家税务局关于企业集团内部使用的有关凭证征收印花税问题的通知》（国税函（2009）9号：对于企业集团内具有平等法律地位的主体之间自愿订立、明确双方购销关系、据以供货和结算、具有合同性质的凭证，应当按规定征收印花税。对于企业集团内部执行计划使用的、不具有合同性质的凭证，不征收印花税。
　　（3）总分支机构人员互派模式下提供劳务、服务中的涉税问题：
　　1.实务案例：某大型跨国外资制造企业，总部广州，在天津设分公司，派驻部分高管人员进行经营管理，包括制造流程的管控、人力资源的管理、核心技术的指导等；工资由广州总部支付，天津分公司支付一部分奖金，营改增后带来的涉税问题：
　　流转税：营改增之后，总分支机构虽然在企业所得税方面实行汇总纳税，但在增值税方面，他们分别属于独立的增值税纳税主体，需要根据具体的服务内容来界定是属于营业税劳务还是营改增应税服务的相应项目。
　　个人所得税：由于该部分外派人员社保、人事关系均在广州总部，但是实际工作地点在天津，工作范围和职责由天津分公司指定，且岗位多为重要核心岗位，所以有可能带来总分支机构关于个人所得税征管的分歧。
　　2.实务案例：某大型金融机构，总部天津，在上海、成都、济南、唐山设有分支机构，
　　个人所得税处理：工资薪金列支的财务核算，实际工作服务地点为主要判断依据

　　三、总分支机构的所得税税务管理：
　　（1）总分机构企业所得税季度预缴、年度汇算清缴涉税处理：
　　国家税务总局2012年第57号：《跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理办法》政策深度解析：详见附表 点击下载
　　（2）总分机构企业所得税分配比例及入库分析处理：
　　财预（2012）40号：《跨省市总分机构企业所得税分配及预算管理办法》的深度解析详见附表。
　　该政策的分析对于部分地区优惠政策中的财政返还的具体计算具有现实意义，便于企业进行税务规划和预算管理。
　　例如，天津市财政局 天津市发展和改革委员会 天津市地方税务局关于印发《天津市促进现代服务业发展财税优惠政策》的通知 津财金〔2012〕24号：
　　一、总部经济
　　（四）对在本市新设立的总部或地区总部，自获利年度起，前二年按其缴纳企业所得税地方分享部分的100%标准给予补助，后三年按其缴纳企业所得税地方分享部分的50%标准给予补助。
　　二、金融业
　　（四）对在本市新设立的金融企业总部核心业务部、金融服务外包机构和金融法人机构，自获利年度起，前二年按其缴纳企业所得税地方分享部分的100%标准给予补助，后三年按其缴纳企业所得税地方分享部分的50%标准给予补助。
　　三、物流业
　　（一）对在本市新设立的注册资本1亿元以上的大型分拨、配送、采购、包装类物流企业及期货交割库，自获利年度起，前二年按其缴纳企业所得税地方分享部分的100%标准给予补助，后三年按其缴纳企业所得税地方分享部分的50%标准给予补助。
　　（二）对在本市新设立的注册资本1亿元以上大型仓储类、运输类企业，自获利年度起，第一年按其缴纳企业所得税地方分享部分的100%标准给予补助，后二年按其缴纳企业所得税地方分享部分的50%标准给予补助。
　　四、中介服务业
　　（二）对在本市新设立的国际、国内知名律师事务所、会计师事务所、资信管理公司、咨询公司、人才中介机构、专业培训机构以及经认定从事专业信息服务的企业等专业服务机构，自获利年度起，前二年按其缴纳企业所得税地方分享部分的100%标准给予补助，后三年按其缴纳企业所得税地方分享部分的50%标准给予补助。
　　五、租赁业
　　（三）对经国家有关部门批准，在本市新设立的金融租赁公司和融资租赁公司法人机构，自获利年度起，前二年按其缴纳企业所得税地方分享部分的100%标准给予补助，后三年按其缴纳企业所得税地方分享部分的50%标准给予补助。
　　六、基金业
　　（二）对在本市新设立并按规定备案的基金管理机构，自获利年度起，前二年按其缴纳企业所得税地方分享部分的100%标准给予补助，后三年按其缴纳企业所得税地方分享部分的50%标准给予补助。

　　四、建筑业总分支机构的税务管理
　　（1）建筑业总分支机构企业所得税的税务管理
　　建筑业由于行业经营的特殊性，建筑业总分机构一直以来在企业所得税和个人所得税税务管理方面成为热点和难点。
　　国家税务总局在1995年出台了《国家税务总局关于建筑安装企业所得税纳税地点问题的通知》国税发（1995）227号，文件规定建筑企业异地施工，持有外出经营活动税收管理证明的，企业所得税回机构所在地缴纳。否则，在施工地就地缴纳企业所得税。为了进一步规范建筑业企业所得税纳税地点的管理，国家税务总局于2010年1月26日下发了《关于建筑企业所得税征管有关问题的通知》）（国税函（2010）39号，文件具体要点分析如下：
　　总体原则：
　　① 跨地区经营，不实行总、分机构体制（施工合同由总机构直接和建设单位签订，由总机构直接以自己名义来项目所在地进行施工）：
　　如果总机构能向项目所在地税务机关提供以其名义签订的合同、外出经营活动税收管理证明、机构所在地主管税务机关提供的纳税证明及相应身份证明的，其企业所得税应回其机构所在地纳税。
　　② 跨地区经营实行总、分机构体制：
　　根据国家税务总局2012年第57号：《跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理办法》规定，分支机构应在项目所在地按月或按季预缴企业所得税。
　　具体税务管理和政策汇总：

　　（2）建筑业个人所得税的涉税管理
　　国税发（1996）127号文件的规定（主要指身份的不同）：

　　国税函（2001）505号文件公布后异地施工的建筑业纳税人的个人所得税处理政策总结（主要指经营地点的不同）：

　　五、利用总分支机构的税务筹划
　　一、低税率总机构尽量多分摊企业所得税---国家税务总局2012年第57号公告
　　第十六条 总机构设立具有主体生产经营职能的部门（非本办法第四条规定的二级分支机构），且该部门的营业收入、职工薪酬和资产总额与管理职能部门分开核算的，可将该部门视同一个二级分支机构，按本办法规定计算分摊并就地缴纳企业所得税；该部门与管理职能部门的营业收入、职工薪酬和资产总额不能分开核算的，该部门不得视同一个二级分支机构，不得按本办法规定计算分摊并就地缴纳企业所得税。
　　根据上述规定，如果总机构设有具有主体生产经营职能的部门（非本办法第四条规定的二级分支机构），且该部门的营业收入、职工薪酬和资产总额与管理职能部门分开核算的，则可以视同分支机构，使得部分应纳税所得额在总机构适用低税率，高税率的分支机构的应纳税所得额会减少。
　　二、总分支机构合并缴纳所得税，分支机构亏损总机构可以弥补
　　总分机构模式下，企业所得税实行法人税制，总分机构属于一个纳税实体，所以，在初设阶段，采用分支机构方式有利于降低税负。
　　三、将总机构设置在税收优惠的地区，整个企业税负可适当降低，而且可以不打破企业原有的区域经营格局（如部分省市相继出台鼓励总部经济的财税优惠政策措施）。

　　六、总分支机构日常经营中几项特殊事项的税务管理
　　（1）税收优惠政策的享受：

　　原则：企业所得税类优惠由于为法人税制，所以总分支机构合并享受；流转税类税收优惠可视具体优惠对象和内容独立享受。
　　（2）资产损失的处理
　　总分支机构资产损失的申报要求（依据国家税务总局2011年25号公告）

　　（3）境内外总分支机构税收抵免：参考文件—所得税法第二十三条、第二十四条，财税（2009）125号：下表盈利亏损概念均为当期。

　　（4）分支机构注销涉税问题管理

　　（5）营改增后增值税总分支机构纳税申报处理（已修订）：国家税务总局2013年第22号公告 财税〔2012〕84号

　　（6）营改增条件下总分支机构的纳税申报操作问题解：文件依据：国家税务总局公告2013年第22号

　　（7）最新营改增试点地区的总分支机构的增值税税务管理，
　　2013年8月1日营改增在全国实行后，国家税务总局重新修订并发布了：关于重新印发《总分机构试点纳税人增值税计算缴纳暂行办法》的通知 财税〔2013〕74号文件，对营改增过程中总分支机构增值税的税务管理进行了进一步规范，请注意区分，具体关注下列政策分析：
　　营改增后增值税总分支机构纳税申报处理：财税〔2013〕74号，

　　案例（选自《中国税务报》）：某航空公司“营改增”试点纳税人分支机构的增值税预征率为1%，总分支机构2013年8月~12月发生《应税服务范围注释》所列业务相关账户核算结果分别为：总机构自身发生不含税收入5000万元，实现销项税额450万元，支付进项税额400万元，实现应纳税额50万元；所属分公司发生不含税收入3000万元，实现销项税额250万元，支付进项税额150万元，实现应纳税额100万元，但按1%的预征率预缴增值税30万元；总机构连同分支机构汇总后在8月~12月实际缴纳增值税120万元。则按照《总分机构试点纳税人增值税计算缴纳暂行办法》中规定的清算办法，年终清算时确定总机构应缴纳增值税为5000×（50＋100）÷（5000＋3000）＝93.75（万元），比平时按汇总缴纳办法实际缴纳的增值税少120－93.75＝26.25（万元）；确定所属分支机构应缴纳增值税为3000×（50＋100）÷（5000＋3000）＝56.25（万元），比平时按预缴办法实际缴纳的增值税多56.25－30＝26.25（万元），可在2014年度少预缴增值税26.25万元。